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Le microbiome est un concept du xxie siècle, théorisé à l’instar du génome. Il s’agit de connaître la totalité de l’information génétique des souches bactériennes du corps humain, alors que le génome consiste en la connaissance de la totalité des gènes de l’être humain. Associé à ce concept contemporain, un autre concept pourrait être étudié et mis en parallèle, il s’agit du commensalisme. C’est une association biologique entre deux espèces différentes où l’une des deux, le commensal obtient un bénéfice, alors que l’autre, l’hôte, n’obtient ni bénéfice, ni désavantage. Issu d’observations en zoologie marine, Pierre-Joseph Van Beneden (1809-1894) va utiliser ce concept dès la fin des années 1860. Cet article se propose d’argumenter le lien entre le commensalisme issu du xixe siècle et le microbiome développé au xxie siècle, en présentant l’instabilité de la relation de commensalisme qui peut en émerger.

Microbiome is a concept developed during the twenty first century, theorized as the same concept as the genome. It consists in the knowledge of all the genes of the bacteria in the human being. For the genome, it is the sequencing of all the genes of the human being himself. With the concept of microbiome, another one can be studied : it is commensalism. Commensalism is a kind of biological association between two different species. One species gets an advantage whereas the other one gets no advantage neither disadvantage. Interpreting observations in marine zoology, Pierre-Joseph Van Beneden (1809-1894) will theorize this concept at the end of the 1860’s. Also this concept will be spread to other fields than zoology, particularly ecology. This article puts forward the links between microbiome and commensalism, showing the instability of the biological association of commensalism.